Описание флага Главного управления специальных программ Президента Российской Федерации
Флаг Главного управления специальных программ Президента Российской Федерации представляет собой прямоугольное полотнище синего (василькового) цвета с Государственным флагом Российской Федерации в крыже.
В центре правой половины полотнища изображен геральдический знак - эмблема Главного управления специальных программ Президента Российской Федерации.
Отношение ширины флага к его длине - два к трем.
Отношение площади крыжа к площади флага - один к четырем.
Отношение высоты эмблемы к ширине флага - один к двум.